脊索动物门 (16854)
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日本深海鳐(Bathyraja pseudoisotrachys)
海洋 深海底的; 深度上下限 297 - 297 m . 深水域
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日本海鰶(Nematalosa japonica)
海洋 底中水层性. 热带; 37°N - 4°N, 98°E - 136°E 河口、近海沿岸、泻湖、礁沙混合区 沿近海中底层洄游性中小型鱼类，有时会进入河口域、半淡硷水之河川下游、内湾或泻湖区内产卵。群游性。以浮游生物为食。
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日本沙鲽(Samariscus japonicus)
海洋 居于水底的. 温带 深海、礁区、砂泥底、近海沿岸 沿岸底栖性鱼类，较常出现于砂泥底质。以底栖鱼类及无嵴椎动物为食。
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日本棘花鮨(Plectranthias japonicus)
海洋 居于水底的; 深度上下限 ? - 200 m . 深水域 礁区、近海沿岸 主要栖息于较深水域的砂砾区。底栖性。内食性，以小型鱼类及甲壳类为食。
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日本桥棘鲷(Gephyroberyx japonicus)
海洋 底中水层性; 深度上下限 320 - 660 m . 温带 深海
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日本栉鳞鳎(Aseraggodes kaianus)
海洋 居于水底的; 深度上下限 150 - 252 m . 深水域 深海、砂泥底、近海沿岸 栖息于大陆棚泥沙底质海域，栖息深度在150-250公尺之间。以底栖性甲壳类为食。
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日本栉鲳(Hyperoglyphe japonica)
海洋 底中水层性; 海洋洄游的 ; 深度上下限 150 - 400 m . 温带 深海、砂泥底、近海沿岸 主要栖息砂沙质海域，幼鱼成群与漂游藻类一起漂流于表层，等长成成鱼后就生活在100公尺以上的底层水域，以浮游性生物为食。
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日本松球鱼(Monocentris japonica)
海洋 礁区鱼类; 深度上下限 10 - 200 m . 热带 礁区、近海沿岸 主要栖息于岩石洞穴及其周缘水域。常成群游动，成鱼栖息深度较广，约在20-200公尺间，幼鱼则偶出现于岸边浅海。主要以浮游动物为食，亦捕食小型甲壳类。
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日本曲鼬鳚(Glyptophidium japonicum)
海洋 底中水层性; 深度上下限 145 - 595 m . 深水域
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日本方头鱼(Branchiostegus japonicus)
海洋 居于水底的; 深度上下限 30 - 200 m . 热带; 40°N - 15°N 砂泥底、近海沿岸 主要栖息于砂泥质海底。活动较深，深度约在水深30-200公尺间。为肉食性之鱼种，以小鱼、虾等为食。
